使用场景
用排序 CDS 面板、分泌信号肽设计与结构置信度检查,实现 Pichia 分泌型 VHH 与纳米抗体表达。
问题
VHH 结构域和纳米抗体小而稳定,适合 Pichia 分泌。但要实现可溶分泌输出,取决于密码子优化、信号肽选择和避免聚集倾向序列特征。团队常默认使用 α-MF 而不评估替代方案,且缺乏在合成前系统排序构建体变体的方法。
Kairos 如何帮助
Kairos 用 Pichia 使用频率表评估你的 VHH 序列,以各轴理由(密码子保真度、合成安全、5′ 起始、可开发性)排序多个 CDS 候选,并用带引用的证据比较分泌信号肽选项。结构置信度筛查在你花钱合成前标注聚集倾向或折叠不良的候选。
诚实边界:Kairos 排序干实验设计质量。不预测表达水平或滴度。输出是基于方向性证据的设计建议。
信号肽比较
α-MF、SUC2 与天然信号肽带引用比较——不再默认 α-MF。
折叠与聚集标注
Boltz-2 置信度筛查,提前标记折叠不良或易聚集的候选。
排序 CDS 面板
候选按各维度带理由排序:密码子保真度、合成安全性、5′ 起始、可开发性。
实例