毕赤酵母表达构建设计

探寻生物制造的热力学极限

一个问题进来,一份可审计的报告出去

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每一步都可检视、可质疑、可复现

确定性审计层逐条核验每项论断——PASS / WARN / FAIL。

可复现

公开且可重跑的数字

确定性设计、可溯证据——Evolrix AI 团队近期发布。

输入HSA 分泌的信号肽
输出排序构建体 + 引用
重跑相同结果
审计每条论断 → 一篇文献
可审计

一个问题进来,一份可审计的报告出去

每次 Kairos 会话都以工作台报告收尾:可溯文献、排序设计面板、结构核验与逐条审计。

文献PubMed · DOI · 专利
图谱人工审校的知识图谱边
阶段管线端到端可溯
文件序列、面板、清单

有据可溯,而非说服。

一家让合成生物学可计算的 AI 公司——大幅缩短从研究问题到可制造设计的路径。设计可证明为正确、评分可重跑、回答有文献依据。

一份 dossier 里有什么

一次 Kairos 会话,实际产出什么

两张工作台实录截图,来自用户提供的 Q6Q4H8 序列——排序后的设计面板与逐条审计。不是摆拍。

Kairos 设计面板:推荐候选的逐轴裁决表,与后方的 Pareto 候选排名面板
设计 —— 推荐候选的逐轴裁决表,与后方的 Pareto 候选排名面板。面板自带范围声明:这是排序信号,不是滴度预测。
Kairos 审计面板:逐条 WARN / PASS 判定与证据分级图例
审计 —— 每条可制造性论断都带 WARN / PASS 判定与理由;面板直说哪些是方向性结论、哪些仍需湿实验。
溯源到可打开的来源

每条论断都能追到一个可打开的出处。

来源 PubMed NCBI AlphaFold DB Boltz-2 专利 人工校验的知识图谱

≈ +0.35蛋白内 Spearman
627条记录
34个可打分 fold
21个跨源

每个数字都可重跑 — 查看基准测试 →  宿主保真度评分 vs 实测滴度,回顾性计算

工作原理

从问题到设计——一条干实验闭环

01 / 提问

可检视、可质疑、可引用的多步推理。

02 / 检索

证据来自文献与知识图谱,全程可溯源。

03 / 审计

确定性审计层逐条核验每项论断——PASS / WARN / FAIL。

平台能力

Kairos 能做什么

  • 排序 Pichia 构建体的合成安全性与宿主相似性
  • 优化表达构建元件——学习到的效应吻合已知生物学(pCS1、ERO1/SBH1)
  • 评估 5′ 翻译起始与蛋白可开发性
  • 干实验结构检查——AlphaFold DB + Boltz-2 置信度
  • 每条论断都引用可打开核验的文献
  • 逐条审计论断——自动化 PASS / WARN / FAIL 判定
  • 评估下游可制造性——发酵工艺、DSP 回收与方向性成本,每个数字都有引用

针对毕赤酵母优化的端到端干实验设计——从带引用的证据到可审计、可下单的构建体。湿实验验证计划通过合作实验室开展——当前交付为干实验设计排序。 完整边界声明 →

常见问题

团队关心的问题

Evolrix AI 是什么?

一家让合成生物学可计算的 AI 公司——大幅缩短从研究问题到可制造设计的路径。设计可证明为正确、评分可重跑、回答有文献依据。

面向谁?

合成生物学、代谢工程与生物技术领域的工业研发团队——从早期设计到生产前验证。

现在能做什么?

Kairos v0.29.0(目前限定毕赤酵母):对话式研究——带引用的证据检索、大模型推理、带宿主保真度评分与表达构建优化(元件效应与已知生物学吻合:pCS1、ERO1/SBH1)的 CDS 候选排序面板、信号肽设计、下游「制造」面板(发酵工艺、DSP 序列、逐级回收率、方向性成本——每个数字都有引用)、假设驱动验证(每条假设都给出 支持 / 有争议 / 未证实 / 证据不足 的判定),以及自动化审查层:每条论断都经 PASS / WARN / FAIL 判定,还会判断所引来源是否真的支撑该论断(是否同一宿主、同一目标,属支持还是矛盾)。正在扩展至更多宿主。

对话是怎么工作的?

用自然语言提出研究问题。闲聊立即得到回答;简单问题得到带引用的快速回复;研究问题直接进入完整管线。Kairos 检索带引用的证据、用大模型推理、运行确定性设计工具,并把结果流式呈现为多面板工作台——证据、设计、结构、制造、审计——聊天里先给出 1–2 屏摘要,Generated Files 下附去重后的溯源清单(PMID / DOI / 专利 / 知识图谱)。每个板块都带出处,审计面板逐条给出 PASS / WARN / FAIL 判定。

Kairos 的适用范围是什么?

Kairos 评估干实验设计质量——合成安全性、宿主相似性、表达构建优化、5′ 翻译起始与蛋白可开发性。表达量与滴度属于湿实验范畴,由湿实验数据回答。

带一个目标蛋白来。带一个排序设计面板走

Kairos 评估干实验设计质量。表达量与滴度属于湿实验范畴,由湿实验数据回答。