证据接地的研究指引 + 可验证的干燥实验设计产物。提出可检验的假设与预实验设计 —— 不是表达量/滴度预测或保证。请在实验台验证。
为什么做这个
AI 研究助手最大的信任问题是引用漂移:模型可能引用一篇检索里根本没有的 PMID,或把设计面板的数字说错。人要逐条回查才能信 —— 这恰恰是 AI 本该替你做的。
Kairos 新增了一个确定性审稿层(把研究流程建成显式的 检索&arr解析&arr设计&arr推理&arr审稿&arr可审计产物 编排图),在给出建议后自动核对三件事:
- 引用真实性 — 推理里引用的每个 PMID/UniProt,是否真的在这次检索到的证据集里?(抓编造引用)
- 数字一致性 — 推理里提到的设计数字(如密码子适配度、host-fidelity 分),是否和设计面板输出一致?(抓数字漂移)
- 论断可溯源 — 每条结论是否有引用支撑,还是无据断言?
审稿输出一个 verdict(PASS / WARN / FAIL),并列出哪些引用溯源到了证据、哪些没有。同时,响应里还带一份 claim 级可审计结构(每条论断 → 证据编号 → 核验状态),供逐条回查 —— 你不用通读全文就能核。
诚实边界(重要):这个审稿层只核可溯源性(引用在不在、数字对不对),不判断科学对错、不预测表达量/滴度。Kairos 一贯的立场不变:它排序的是干燥实验的设计质量,真实产量永远交给湿实验验证。
一次真实运行(线上,未修饰)
提问:What signal peptide for secreted expression in Pichia?(Pichia 分泌表达该用什么信号肽?)
检索命中 6 篇相关文献 + 知识图谱节点,包括:
- PMID:29601964 — 通过信号肽优化提升 Pichia 中抗 HIV VRC01 抗体的表达
- PMID:41660601 — 信号肽的拓扑、切割位点与分泌效率的依赖关系
- PMC11018594 — P. pastoris X33 分泌表达重组酶 PMGL-Ba 的验证
推理(真实 Qwen3,英文原文中译):
"信号肽是 Pichia 分泌表达的关键,其效力依赖于正确的拓扑、切割位点及与目标蛋白的兼容性(PMID:41660601)。系统性的信号肽优化已被证明能提升抗体产量(PMID:29601964),但具体的信号肽序列在所提供的证据中并未详述。"
注意模型主动承认"具体序列未在证据中提供" — 不编造。
自动审稿(第 6 节,线上真实输出):
## 6. Review (automated citation/number audit — verdict: PASS)
- ✅ Citations traced to evidence: PMID:29601964, PMID:41660601审稿层核对了模型引用的两个 PMID — 两个都确实在这次检索到的证据集里,无编造引用 → 引用溯源：PASS。此外,响应里附带一份 claim 级可审计结构,把每条结论连到对应证据编号,可逐条回查。与首页一致,此 PASS 确认的是可溯源性,而非科学正确性或相关性——被引来源仍可能是间接或不完全对靶的;自动相关性/蕴含性评分在路线图上。
审稿层是怎么被验证的
上线前,我们用对抗测试压过它抓错的能力(构造模型故意犯错的样本):
- 编造引用
PMID:99999999(不在证据里)→ 被标记为 missing,verdict 降级 - 数字漂移(推理说 fidelity 0.95,设计面板是 0.82)→ 被标记为 mismatch,verdict FAIL
- 无据断言("一定能表达到 5 g/L")→ 被标记为未接地论断
然后在真实 Qwen3 输出上验证它不误报:上面那次真实运行,模型引用诚实、无编造,审稿层正确判 PASS — 证明它不是"逢引用就报警",而是真的在核对。
这一步的意义
Kairos 研究工作台现在的每一份研究指引都自带一层可溯源的审稿:引用真实、数字一致、论断可查。这让"AI 给的研究建议"从"要不要信"变成"可以核"。
配合已有的三层证据溯源(检索引用 · 推理 · 确定性设计工具)和 host-fidelity 设计排序,Kairos 正在成为一个你能审计每一步的 Pichia 研究工作台。
llm:qwen3-14b,本地检索),2026-07-09。参考文献
- Aw R, McKay PF, Shattock RJ, et al. A systematic analysis of the expression of the anti-HIV VRC01 antibody in Pichia pastoris through signal peptide optimization. Protein Expr Purif, 2018. PMID:29601964
- Dorogova NV, Fedorova SA. Overcoming the problem of heterologous proteins folding to improve the efficiency of yeast bioproducers. Vavilovskii Zhurnal Genet Selektsii, 2025. PMID:41660601
- Li J, Yang M, Zhao F, et al. Efficient expression of an alkaline pectin lyase from Bacillus licheniformis in Pichia pastoris. Bioresources and Bioprocessing, 2024. PMC11018594