基准与方法

≈ +0.35

Kairos 宿主保真度奖励与实测滴度的 Spearman 相关，蛋白内计算、跨 5 个蛋白取平均（28 个真实 PichiaCLM 变体）。设计质量排序——不是滴度预测。

逐蛋白 Spearman

每个蛋白内部计算奖励与滴度相关性，跨 5 个蛋白取平均。基于 PichiaCLM 数据的回顾性指标；n=5——逐蛋白数值波动大（5 个中 1 个为负），均值是方向性信号、置信区间宽。

≈ 0.057–0.265

跨蛋白构建体排序，2026-07-29 重新钉定：保守源内（去混淆）ρ ≈ 0.057；跨源 ρ ≈ 0.265（含实验室尺度效应）；总体 ≈ 0.328。LOGO 评估。

~627 条记录

627 条记录；34 个可打分 fold，其中 21 个跨源（去混淆口径：22 个可打分、9 个跨源）。回顾性校准器评估；不是表达或滴度的前瞻预测器。

合成安全性

限制位点、重复序列、GC 含量、终止密码子——阻断合成的硬约束。

5′ 翻译起始

Kozak 上下文、二级结构、起始密码子可及性。

宿主密码子保真度

针对 Pichia 使用频率表的密码子适配；蛋白内奖励对滴度 ρ ≈ +0.35。

可开发性

蛋白层面标注：聚集倾向、糖基化位点、稳定性信号。