基准测试
Kairos v0.4.0 的回顾性干实验设计质量指标。每个数字都可从确定性设计工具复现——无黑箱评分。
宿主保真度
Kairos 按每个目标的 CDS 候选密码子使用与宿主（Pichia）的相似度进行排序。蛋白内排序相关性（Spearman ρ）衡量高分候选是否一致地被优先选择。
≈ +0.35
Kairos 密码子奖励与宿主相似度之间的 Spearman 相关，蛋白内计算。正值 = 高分候选更接近宿主。
LOGO CV
留一组交叉验证（Leave-one-group-out）。回顾性——基于现有数据计算，非前瞻验证。
表达构建体优化
Kairos 从表达构建体数据中学习元件效应。学习到的效应与已知生物学一致：pCS1 和 ERO1/SBH1 启动子/终止子元件显示预期方向性影响。跨源泛化能力在不同独立数据队列上测量。
≈ 0.12–0.26
跨源 fold 的 Spearman ρ。范围反映方法相关变异（源内标准化开/关）。下界 = 保守估计。
~627 条记录
21 个跨源 fold。回顾性校准器评估；不是表达或滴度的前瞻预测器。
覆盖
每个设计候选在多个轴上评分——每个轴都是确定性、可重运行的计算：
合成安全性
限制位点、重复序列、GC 含量、终止密码子——阻断合成的硬约束。
5′ 翻译起始
Kozak 上下文、二级结构、起始密码子可及性。
宿主密码子保真度
针对 Pichia 使用频率表的密码子适配；蛋白内排序 ρ ≈ +0.35。
可开发性
蛋白层面标注：聚集倾向、糖基化位点、稳定性信号。