使用场景
用带引用的证据、排序 CDS 面板与分泌策略,设计工业酶制剂的 Pichia 表达构建体。
问题
工业酶——纤维素酶、脂肪酶、植酸酶——需要在 Pichia 中实现高分泌产量。设计空间巨大:密码子使用、信号肽选择、启动子强度、拷贝数。团队花数周迭代构建体,最终在湿实验阶段失败,原因往往是计算机可见的设计缺陷:密码子适配差、Kozak 上下文不利、或信号肽不匹配。
Kairos 如何帮助
Kairos 检索目标酶的带引用证据,生成针对 Pichia 密码子使用优化的排序 CDS 面板,评估分泌信号肽候选(α-MF、SUC2、天然),并检查每个构建体的合成安全性、翻译起始和可开发性标注。每个评分都是确定性、可重运行的——你能看到为什么一个候选排在另一个之上。
诚实边界:Kairos 排序干实验设计质量。不预测表达水平或滴度。输出是基于方向性证据的设计建议。
可溯证据图谱
围绕你的酶类检索文献与专利证据——每条论断都可追溯到来源。
排序 CDS 面板
Pareto 排序的候选序列,带宿主保真度评分——匹配 K. phaffii 密码子节奏,而非简单的 max-CAI。
构建体检查
合成安全性、5′ 翻译起始与可开发性标注——在你为合成买单之前完成。
实例